在太平洋和大西洋之间的一个小岛――巴库里附近，经常莫明其妙地发生各类船只失踪、沉没事件，先锋号潜水艇奉命去调查这一离奇事。可是就在先锋号即将启程的前夜，先锋号启程的时间，到达的地点等绝密情报却意外地泄露出去。两个嫌疑犯一个诈死逃脱，一个上了即将出发的先锋号潜水艇。苏联公安人员兵分两路，一路经过周密探查，在一家旅馆逮捕了发报人伊万绍夫。另一路在先锋号船长瓦伦佐夫的带领下，透过重重迷雾，终于一举抓获埋藏多年的破坏分子工程师果烈洛夫，捣毁了敌对分子长期经营的发射基地和发报点。也解开了这一地区，长期以来，不断发生船只沉没、失踪的秘密，也就是所谓两个海洋的秘密。